Een goede barrièrefunctie van de darm is belangrijk omdat wij dagelijks worden blootgesteld aan een groot aantal microbiële antigenen, moleculen die ons afweersysteem in werking stellen. Een overgroei van darmbacteriën (vooral Gram-negatieven) kan resulteren in een verhoogde doorlaatbaarheid van de darm. Met als consequentie bijvoorbeeld bacteriële translocatie en de productie van TNF-a, een cytokine dat ontstekingsreacties bevordert. Pre- en probiotica zouden dergelijke effecten kunnen beïnvloeden.